Фитобочка оказывает целебное воздействие на всю нервную систему, расширяя периферические кровеносные сосуды в мышцах, подкожной жировой клетчатке и коже. При этом наблюдается отток крови от мозга, что способствует снижению активности его корковых структур. В результате этого наступает релаксация, торможение и спокойствие. Значительное число факторов воздействия фитобочки на организм человека становятся возможными посредством нервной системы. Например, под воздействием фитобочки происходит изменение функциональных свойств нервной системы (длительность реакций, их скорость и степень выраженности). Многократное применение таких процедур направлено на совершенствование процессов, осуществляющихся на различных уровнях рефлексов.
В этот период наблюдается оптимизация регуляторных способностей организма человека, шлифуются безусловные рефлексы и отрабатываются условные рефлексы. Отмечается массивное воздействие на ЦНС и ВНС (центральную и вегетативную нервную систему). Посещение фитосауны позволяет забыть о проблемах и отключиться от навязчивых мыслей. Фитобочка способствует регулированию вегетативного тонуса и исправлению его аномалий, особенно в стрессовых ситуациях. Во время принятия этих процедур наблюдается активизация нейроэндокринной системы, приводящая к выбросу в организм большого количества гормонов. Замечено, что регулярное посещение фитосауны и вырабатывает устойчивость организма к стрессам и закаляет его.